JavaScriptを記述する時は、script タグを使用し、その中に書きます。
type属性には、text/javascript を記述し、このスクリプトは、JavaScriptであることを伝えます。

記述する場所は、head要素の中でもbody要素の中でも記述することができます。

JavaScriptに対応していないブラウザの場合は、JavaScriptがブラウザにそのまま表示されてしまうので、念のためHTMLのコメントで囲いましょう。

<script type="text/javascript">
<!--
//ここにJavaScriptを記載します。
-->
</script>