/etc/my.cnf に設定している文字コードを確認するには、SHOW VARIABLES コマンドを使用します。
SHOW VARIABLES は、MySQL システムの環境変数を確認します。

mysql> show variables like 'character_set%';

または、以下のコマンドでも確認可能です。

mysql> status

[対象]
MySQL 5.x.x